記者從中科院青島生物能源與過(guò)程研究所獲悉,該所仿真模擬團隊近日設計出一套計算機虛擬篩選結合分子生物學(xué)實(shí)驗方法,成功提高了枯草芽孢桿菌藍色熒光蛋白質(zhì)YtVALOV的穩定性。
蛋白質(zhì)作為藥物、生物制劑和催化劑被人們廣泛應用,其穩定性對于生物技術(shù)應用具有重要影響。通常蛋白質(zhì)的穩定性可以通過(guò)定向進(jìn)化、序列同源比對和理性設計來(lái)完成,但這些方法都各有優(yōu)缺點(diǎn)。
科研人員介紹,該方法主要包括5個(gè)步驟。首先,科研人員采用計算機模擬對可能的熱穩定突變進(jìn)行篩選。第二步,他們對篩選出的較重要突變體進(jìn)行實(shí)驗驗證。第三個(gè)程序,他們使用計算模擬對實(shí)驗確認的位點(diǎn)及其周?chē)M(jìn)行氨基酸再優(yōu)化。之后,他們對優(yōu)化的突變位點(diǎn)進(jìn)行實(shí)驗表征。最后,科研人員再對獲取的穩定突變進(jìn)行組合。實(shí)驗中,采用該方法成功將枯草芽孢桿菌藍色熒光蛋白質(zhì)YtVALOV的Tm值(DNA熔解溫度)提高了
據介紹,該方法的優(yōu)勢在于不受蛋白質(zhì)體系本身限制,理論上可以用來(lái)提高任何具有三維結構的蛋白質(zhì)的穩定性,對穩定性差的蛋白質(zhì)制劑改性具有重要意義