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按照這一方案，從今年9月起，中央補貼資金總額的90％將按交售量補給棉農，其余10％，面向喀什、和田、阿克蘇地區以及克孜勒蘇柯爾克孜自治州4個南疆地州，向“基本農戶”兌付棉花種植面積部分的補貼。
2014年度的試點工作中，執行的是中央補貼資金的60％按棉花種植面積來補，40％按實際交售量來補。但“面積＋交售量”的補貼方式存在工作量大、行政成本較高等弊端。
自治區發展改革委主任張春林說，為了方便農民，今年新疆還將實行電子化的“種植證明”，不再使用原先的紙質版。目前，新疆絕大部分棉農的種植情況已被錄入系統，農民可直接交售。
2014年9月，國家首次在新疆實施棉花目標價格試點工作，同時取消棉花臨時收儲。此后，我國棉花價格開始由市場供求形成，政府不再干預市場價格。
所謂目標價格，是指在保障農民獲得一定收益的前提下，國家有關部門根據農產品種植成本制定出的預期價格。如果在收獲時，農產品的市場價格低于目標價格，將按照差額補貼給農民；如果市場價格高于目標價格，則不發放補貼。
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